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育种值 表型值 回归系数 相关系数 遗传力之间的关系

时间:2019-06-07 19:42:04来源:IT技术作者:seo实验室小编阅读:73次「手机版」
 

育种值

假定表型值由均值+育种值+残差

yi=μ+ai+ϵi y_i = \mu + a_i + \epsilon_iyi​=μ+ai​+ϵi​

表型值 VS 育种值

他们之间的相关系数

cor(y,a)=Cov(y,a)Var(y)Var(a) cor(y,a) = \frac{Cov(y,a)}{\sqrt{Var(y)*Var(a)}}cor(y,a)=Var(y)∗Var(a)​Cov(y,a)​

其中:

Cov(y,a)=Cov(μ+a+ϵ,a)=Cov(a,a)=Var(a) Cov(y,a) = Cov(\mu + a + \epsilon, a) = Cov(a,a) = Var(a) Cov(y,a)=Cov(μ+a+ϵ,a)=Cov(a,a)=Var(a)

所以:

cor(y,a)=Var(a)Var(y)Var(a)=Var(a)Var(y)=h2cor(y,a) = \frac{Var(a)}{\sqrt{Var(y)*Var(a)}} = \sqrt{\frac{Var(a)}{Var(y)}} = \sqrt{h^2} cor(y,a)=Var(y)∗Var(a)​Var(a)​=Var(y)Var(a)​​=h2

回归系数 VS 相关系数 VS 遗传力

回归系数:

ba,y=Cov(y,a)Var(y)=Var(a)Var(y)=h2 b_{a,y} = \frac{Cov(y,a)}{Var(y)} = \frac{Var(a)}{Var(y)} = h^2ba,y​=Var(y)Cov(y,a)​=Var(y)Var(a)​=h2

回归系数和相关系数:

ba,y=cor2(a,y)=h2 b_{a,y} = cor^2(a,y) = h^2ba,y​=cor2(a,y)=h2

育种值 VS 表型值 VS 遗传力

a=h2(yμ)a = h^2(y - \mu)a=h2(y−μ)

结论:

由此可以知道, 在模拟数据时, TBV和phenotype的关系, 以及与遗传力的关系为:

cor(TBV,phenotype)=h2 cor(TBV, phenotype) = \sqrt{h^2}cor(TBV,phenotype)=h2

TBV=b+aphenotype TBV = b + a*phenotype TBV=b+a∗phenotype

a 为回归系数:

a=h2a = h^2a=h2

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